MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp5

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021993	TCCG	2	8	3	10	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021993	TCA	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021993	GAAC	2	8	67	74	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021993	CGG	2	6	106	111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021993	G	6	6	110	115	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021993	TCA	2	6	145	150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021993	TTC	2	6	162	167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021993	TGA	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021993	GA	3	6	198	203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021993	GGA	2	6	209	214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021993	CTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021993	TGT	2	6	360	365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021993	GCT	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021993	ATC	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021993	AAT	2	6	465	470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021993	TTA	2	6	487	492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021993	TAT	2	6	501	506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021993	GAT	2	6	523	528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021993	ATT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021993	TCC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021993	CCA	2	6	709	714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021993	TGC	2	6	747	752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021993	CAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021993	TTTG	2	8	872	879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021993	ATT	2	6	894	899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021993	AT	3	6	922	927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021993	AAT	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021993	TTA	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232702
29	NC_021993	GCA	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232702
30	NC_021993	ATGC	2	8	1067	1074	25 %	25 %	25 %	25 %	529232702
31	NC_021993	T	8	8	1077	1084	0 %	100 %	0 %	0 %	529232702
32	NC_021993	ATC	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232702
33	NC_021993	GGT	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232702
34	NC_021993	TG	3	6	1245	1250	0 %	50 %	50 %	0 %	529232702
35	NC_021993	TCG	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232702
36	NC_021993	GCT	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232702
37	NC_021993	TGG	2	6	1362	1367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232702
38	NC_021993	T	6	6	1418	1423	0 %	100 %	0 %	0 %	529232702
39	NC_021993	AAC	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021993	AAGA	2	8	1514	1521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021993	AATCC	2	10	1528	1537	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_021993	C	6	6	1547	1552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_021993	T	6	6	1553	1558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021993	CGG	2	6	1589	1594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021993	GCTC	2	8	1616	1623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021993	CCGG	2	8	1633	1640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021993	AAGG	2	8	1668	1675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021993	GT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021993	AGA	2	6	1796	1801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
50	NC_021993	CCA	2	6	1814	1819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232703
51	NC_021993	GCA	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232703
52	NC_021993	GCG	2	6	1842	1847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232703
53	NC_021993	GCG	2	6	1903	1908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232703
54	NC_021993	GGC	2	6	1944	1949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232703
55	NC_021993	TC	3	6	2027	2032	0 %	50 %	0 %	50 %	529232703
56	NC_021993	CAA	2	6	2070	2075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232703
57	NC_021993	GCAGGC	2	12	2100	2111	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529232703
58	NC_021993	GTGGCC	2	12	2225	2236	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529232703
59	NC_021993	GCC	2	6	2284	2289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232703
60	NC_021993	GCCA	2	8	2344	2351	25 %	0 %	25 %	50 %	529232703
61	NC_021993	CCG	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232703
62	NC_021993	CCG	2	6	2451	2456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232703
63	NC_021993	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
64	NC_021993	GAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
65	NC_021993	CAT	2	6	2538	2543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232703
66	NC_021993	TTG	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232703
67	NC_021993	GAG	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232703
68	NC_021993	TC	3	6	2661	2666	0 %	50 %	0 %	50 %	529232703
69	NC_021993	CAT	2	6	2668	2673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232703
70	NC_021993	CGT	3	9	2728	2736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232703
71	NC_021993	GC	3	6	2754	2759	0 %	0 %	50 %	50 %	529232703
72	NC_021993	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232703
73	NC_021993	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
74	NC_021993	TGG	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232703
75	NC_021993	A	6	6	3004	3009	100 %	0 %	0 %	0 %	529232703
76	NC_021993	GAT	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232703
77	NC_021993	CAT	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232703
78	NC_021993	TG	3	6	3116	3121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021993	TG	3	6	3126	3131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021993	T	8	8	3248	3255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021993	ATG	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021993	CAGA	2	8	3434	3441	50 %	0 %	25 %	25 %	529232704
83	NC_021993	TGGTC	2	10	3472	3481	0 %	40 %	40 %	20 %	529232704
84	NC_021993	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232704
85	NC_021993	GCAG	2	8	3521	3528	25 %	0 %	50 %	25 %	529232705
86	NC_021993	A	6	6	3540	3545	100 %	0 %	0 %	0 %	529232705
87	NC_021993	GAGC	2	8	3560	3567	25 %	0 %	50 %	25 %	529232705
88	NC_021993	GCC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232705
89	NC_021993	CAG	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232705
90	NC_021993	TGC	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232705
91	NC_021993	GGC	2	6	3856	3861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232706
92	NC_021993	CCCT	2	8	3904	3911	0 %	25 %	0 %	75 %	529232706
93	NC_021993	CG	3	6	3918	3923	0 %	0 %	50 %	50 %	529232706
94	NC_021993	GCCA	2	8	3940	3947	25 %	0 %	25 %	50 %	529232706
95	NC_021993	GTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232706
96	NC_021993	TCG	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232706
97	NC_021993	TTC	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232706
98	NC_021993	CAA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232707
99	NC_021993	CAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232707
100	NC_021993	GC	3	6	4294	4299	0 %	0 %	50 %	50 %	529232707
101	NC_021993	TCG	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232707
102	NC_021993	GCA	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232707
103	NC_021993	CGC	2	6	4381	4386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232707
104	NC_021993	CAT	3	9	4387	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232707
105	NC_021993	CAT	3	9	4450	4458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232707
106	NC_021993	TGGGA	2	10	4491	4500	20 %	20 %	60 %	0 %	529232707
107	NC_021993	TG	3	6	4582	4587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021993	TTA	2	6	4647	4652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021993	A	7	7	4731	4737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021993	AT	3	6	4795	4800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021993	GA	3	6	4874	4879	50 %	0 %	50 %	0 %	529232708
112	NC_021993	CGCA	2	8	4885	4892	25 %	0 %	25 %	50 %	529232708
113	NC_021993	GCCT	2	8	4973	4980	0 %	25 %	25 %	50 %	529232708
114	NC_021993	CT	3	6	4979	4984	0 %	50 %	0 %	50 %	529232708
115	NC_021993	CTGTGG	2	12	5043	5054	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	529232708
116	NC_021993	GCC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232708
117	NC_021993	TGC	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232708
118	NC_021993	GAAG	2	8	5423	5430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021993	TTG	2	6	5463	5468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021993	CGC	2	6	5492	5497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232709
121	NC_021993	CCGT	2	8	5573	5580	0 %	25 %	25 %	50 %	529232709
122	NC_021993	TCA	2	6	5645	5650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232709
123	NC_021993	GCT	2	6	5681	5686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232709
124	NC_021993	GGT	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232709
125	NC_021993	TCA	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232709
126	NC_021993	GTGG	2	8	5771	5778	0 %	25 %	75 %	0 %	529232709
127	NC_021993	CGGT	2	8	5790	5797	0 %	25 %	50 %	25 %	529232709
128	NC_021993	GTT	2	6	5814	5819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232709
129	NC_021993	GGT	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232709
130	NC_021993	TGT	2	6	5880	5885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232709
131	NC_021993	AGCC	2	8	5897	5904	25 %	0 %	25 %	50 %	529232709
132	NC_021993	GCT	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232709
133	NC_021993	TTCA	2	8	5993	6000	25 %	50 %	0 %	25 %	529232709
134	NC_021993	GAAC	2	8	6149	6156	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021993	TAAG	2	8	6178	6185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021993	GT	3	6	6251	6256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021993	GAA	2	6	6259	6264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021993	TGC	2	6	6276	6281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232710
139	NC_021993	AGAA	2	8	6403	6410	75 %	0 %	25 %	0 %	529232710
140	NC_021993	TGT	2	6	6446	6451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232710
141	NC_021993	GT	3	6	6450	6455	0 %	50 %	50 %	0 %	529232710
142	NC_021993	GCG	2	6	6461	6466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232710
143	NC_021993	GCA	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232710
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184	NC_021993	ATGAC	2	10	8762	8771	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_021993	TTA	2	6	8860	8865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_021993	GGC	2	6	9395	9400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_021993	ATG	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_021993	GGAT	2	8	9482	9489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_021993	TGA	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_021993	CCG	2	6	9887	9892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.